| | | LOS XINDI Titulo original: The Xindi Dirigido por Allan Kroeker Primera emisión: 10 de Septiembre de 2003 Número: 53 [3x01] |   | |
| | | ANOMALÍAS Titulo original: Anomaly Dirigido por David Straiton Primera emisión: 17 de Septiembre de 2003 Número: 54 [3x02] |   | |
| | | EXTINCIÓN Titulo original: Extinction Dirigido por LeVar Burton Primera emisión: 24 de Septiembre de 2003 Número: 55 [3x03] |   | |
| | | RAJIIN Titulo original: Rajiin Dirigido por Mike Vejar Primera emisión: 1 de Octubre de 2003 Número: 56 [3x04] |   | |
| | | IMPULSO Titulo original: Impulse Dirigido por David Livingston Primera emisión: 8 de Octubre de 2003 Número: 57 [3x05] |   | |
| | | EXILIO Titulo original: Exile Dirigido por Roxann Dawson Primera emisión: 15 de Octubre de 2003 Número: 58 [3x06] |   | |
| | | EL CARGAMENTO Titulo original: The Shipment Dirigido por David Straiton Primera emisión: 29 de Octubre de 2003 Número: 59 [3x07] |   | |
| | | ENTRE DOS MUNDOS Titulo original: Twilight Dirigido por Robert Duncan McNeill Primera emisión: 5 de Noviembre de 2003 Número: 60 [3x08] |   | |
| | | ESTRELLA DEL NORTE Titulo original: North Star Dirigido por David Straiton Primera emisión: 12 de Noviembre de 2003 Número: 61 [3x09] |   | |
| | | SIMILITUD Titulo original: Similitude Dirigido por LeVar Burton Primera emisión: 19 de Noviembre de 2003 Número: 62 [3x10] |   | |
| | | LA CALLE CARPENTER Titulo original: Carpenter Street Dirigido por Mike Vejar Primera emisión: 26 de Noviembre de 2003 Número: 63 [3x11] |   | |
| | | EL REINO ELEGIDO Titulo original: Chosen Realm Dirigido por Roxann Dawson Primera emisión: 14 de Enero de 2004 Número: 64 [3x12] |   | |
| | | TERRENO DE PRUEBAS Titulo original: Proving Ground Dirigido por David Livingston Primera emisión: 21 de Enero de 2004 Número: 65 [3x13] |   | |
| | | ESTRATAGEMA Titulo original: Stratagem Dirigido por Mike Vejar Primera emisión: 4 de Febrero de 2004 Número: 66 [3x14] |   | |
| | | EL HERALDO Titulo original: Harbinger Dirigido por David Livingston Primera emisión: 11 de Febrero de 2004 Número: 67 [3x15] |   | |
| | | LAS ÓRDENES DEL DOCTOR Titulo original: Doctor's Orders Dirigido por Roxann Dawson Primera emisión: 18 de Febrero de 2004 Número: 68 [3x16] |   | |
| | | EL VIVERO Titulo original: Hatchery Dirigido por Michael Grossman Primera emisión: 25 de Febrero de 2004 Número: 69 [3x17] |   | |
| | | AZATI PRIME Titulo original: Azati Prime Dirigido por Allan Kroeker Primera emisión: 3 de Marzo de 2004 Número: 70 [3x18] |   | |
| | | DAÑOS Titulo original: Damage Dirigido por James L. Conway Primera emisión: 21 de Abril de 2004 Número: 71 [3x19] |   | |
| | | LOS OLVIDADOS Titulo original: The Forgotten Dirigido por LeVar Burton Primera emisión: 28 de Abril de 2004 Número: 72 [3x20] |   | |
| | | E² Titulo original: E² Dirigido por Roxann Dawson Primera emisión: 5 de Mayo de 2004 Número: 73 [3x21] |   | |
| | | EL CONSEJO Titulo original: The Council Dirigido por David Livingston Primera emisión: 12 de Mayo de 2004 Número: 74 [3x22] |   | |
| | | CUENTA ATRÁS Titulo original: Countdown Dirigido por Robert Duncan McNeill Primera emisión: 19 de Mayo de 2004 Número: 75 [3x23] |   | |
| | | HORA CERO Titulo original: Zero Hour Dirigido por Allan Kroeker Primera emisión: 26 de Mayo de 2004 Número: 76 [3x24] |   | |